مكافحة التهريب الجمركـي والتهـرب الضريبـي.
مراقبة حركة البضائع التي تدخل وتخرج من وإلى مناطق السلطة الفلسطينية.
تحسين تحصيل الإيرادات لرفد وزيادة خزينة الدولة الفلسطينية من خـلال المقاصات والضرائب.
مكافحـة بضائـع المستوطنـات ومنـع تداولهـا داخل الأسواق الفلسطينية.
حماية السوق المحلي والتجارة الشرعية وتشجع الاستثمار.
حمـايـة البيـئـة مـن المخلفـات والنفـايـات الإسرائيليـة.
مكافحة البضائع الفاسدة والمزورة والمنتهية الصلاحية وغير المطابقة للمواصفات والمقاييس.
التعاون مع الوزارات الشريكة: الاقتصاد الوطني، الصحة، الزراعة، الاتصالات وتكنولوجيا المعلومات، البيئة، المحافظة، وكافة الأجهزة الأمنية